Lo que pasa es que cuando gestionas tu ipod automáticamente, el ipod se expulsa cuando termine de sincronizar con la biblioteca del iTunes. Es normal
Y cada vez que hagas cambios en la biblioteca, se reflejará en la próxima sincronización, y es por eso que probablemente se vaya a estar borrando.
Por lo tanto, es mejor la sincronización manual. Y también podrás explusar manualmente el ipod.
Te dejo este enlace, de la guía de spky, preguntas frecuentes: viewtopic.php?f=2&t=7284
Te hago el favor y te pongo la parte que nos interesa:
La actualización manual es quizás más "trabajosa" pero, en mi opinión, más clara de trabajar. Tendremos que arrastrar las canciones/videos desde la Biblioteca del iTunes al iPod. Luego de hacerlo, podremos borrarlas de nuestra computadora (o pasarlos a un CD o lo que querramos!)
Paso a paso, usando mi método personal (que no es el único pero a mi me da resultado)
* Creo una lista de reproducción nueva en el iTunes llamada Nuevos y la abro.
* Arrastro desde el Explorador de Windows a esa lista los archivos (canciones o videos) que quiera poner en el iPod. Nota importante: los nombres de los archivos tienen que ser lo más simples posibles, nada de nombres largos ni caracteres extraños.
[Hasta acá lo que hicimos fue ni más ni menos que poner los archivos al iTunes...]
* Conecto el iPod. Espero unos segundos y me doy cuenta que está todo bien pues aparece en la barra de la izquierda un ícono que representa el iPod.
* Selecciono el contenido de la lista Nuevos. Cómo lo hago? Clic izquierdo en el primero de la lista, aprieto la tecla Shift y la mantengo presionada, clic izquierdo en el último de la lista.
* Arrastro todos los archivos seleccionados al ícono del iPod.
[Acabamos de pasar los archivos al iPod! Si sale algún mensaje de error puede ser que los nombres sean largos o los formatos de los archivos no compatibles]
* Selecciono todos los archivos de nuevo de la lista Nuevos y los borro (clic derecho, Borrar) Hago esto porque no uso el iTunes para otra cosa más que para pasar los archivos al iPod. Esto mismo tendría que hacer cuando quieres borrar tal o cual canción/video del iPod cuando está en modo de actualización manual.
Si algo no te queda claro, me dices.