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Yo desinstalaría el iSwitcher, es poco útil, te recomiendo instalarte los temas manualmente y pasarlos a través de USB (oWi-Fi, como quieras, pero por USB evidentemente es más rapido). Aquí tienes un monton de temas que puedes instalar manualmente metiendo la carpeta en /private/var/root/Library/SummerBoard/Themes.
Después, intenta poner otro theme con el Summberboard y asegúrate de que esté activada la opción "Theme icons".
De todas formas, si abres el iSwitcher y te vas a donde sale el logo, leerás abajo "Select this panel to load your backup icons", función que debería restaurar los iconos por defecto. Si no, también puedes restaurar los iconos desde preferencias>general>restaurar.
De todas formas, lo dicho, no te recomiendo el iSwitcher entre otras cosas porque está muy enfocado al iPhone.