LA verdad es q si es raro, Gspot suele ser bastante exacto a la hora de "analizar" un archivo. Tb es cierto q WMV es el peor formato de video q pueda existir.
Usa GraphEdit para ver el graph q se forma. Abres el programita, arrastra el video dentro de graphedit y se deberá de formar un grafico con la cadena de filtros. Lo normal es q la cadena sea:
Nombre del archivo -> Codec WMAudio Decoder DMO -> Sound
-> Codec WMVideo Decoder DMO -> Renderer
Si se forma el graph correctamente megui no debería tener problema en abrirlo. Tb es posible q el archivo WMV esté algo dañado, y de ahí a q Gspot no detecte correctamente la resolución. Puede tener la cabecera dañada. Como te digo siempre q se pueda evitar WMV mejor, no para megui, para todo. De todos modos MEgui no debería tener problemas en convertirlos, he tenido q pasar alguna vez alguno y como te digo sin problemas.