el problema es que como salves toda la carpeta Documents puedes liarla bien. En todo caso si es algo concreto lo que te interesa, ir a por ello expresamente, no salvarlo todo.
Por ejemplo, yo lo que tengo hecho es un script, al ejecutarlo desde el mismo iPod simplemente me crea un ZIP con todos los datos que siempre saco, que por otro lado son siempre los mismos: Agenda, calendario, notas, tiempo y bolsa, algunos ajustes de SSH.. Cuando restauro a una nueva versión lo único que hago es copiar el Script de restauración y la carpeta ZIP, lo ejecuto y listo.
Al acabar sincronizo con itunes musica, videos, fotos... y todo como nuevo en tan solo dos minutos? bueno la sincro de la musica es mas de dos minutos, pero me refiero a mis cosas
Los dos script igualmente los voy actualizando si necesito guardar o restaurar alguna cosa nueva, pero el 99% están ya preparados.