la contraseña es la misma para ambos. Lo único q te ha podido suceder, es q la primera vez q intentas usar Putty o WinSCP tarda mucho. Si la primera vez la primera conexion la haces con WinSCP te dará un error de tiempo de espera, pero solo eso.
si no está modificada, el usuario es "root" para superusuario y "mobile" como usuario normal, y la contraseña en cualquiera de lso dos casos es "alpine".
Sobre lo primero si, pero no, no tendrías q instalar cydia de nuevo ni roch ni nada, en teoría todo se mantiene, solo que para poder arrancarlo es necesario hacer uso de nuevo de blackrain. Es decir, apagarlos, encenderlo, hacerlo andar con blackrain y listo.