Si, antes de instalar nada de nada, se quedaba en el bucle infinito tan pronto iniciaba tras el JB. Pero es que eso era también lo que hacía antes de restaurarlo y también si lo restauraba a un Backup con todas las apps instaladas.
No me preguntes por que demonios ha funcionado pero desactivando el bloqueo automático cuando estaba con la configuración de fabrica ha eliminado el problema...