miguel_delgado_3
No te va a funcionar nada de lo mencionado anteriormente, ni cambio de permisos, ni eliminación del archivo,.... lo unico que te quedaría por probar antes de hacer una restauración es conseguir un archivo "notes.db" limpio, es decir, un archivo "notes.db" creado justo después de Restaurar a la 2.1, y aun así posiblemente seguirá sin funcionar correctamente la aplicación.
Yo personalmente te recomendaría Restaurar tu iPod y hacer de nuevo el JailBreak, porque así si es seguro que solucionarás tu error en la aplicación Notas.
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iPod Touch 16GB (3.1.3 JB)
iPhone 4 16GB (6.1.2 JB)