Yo le veo un par de problemas a "copiar y pegar":
1º: Puedes corromper la base de datos del ipod, que ya de por sí no es muy estable.
2º: ¿has visto como organiza por dentro el Ipod las canciones?. Las carpetas no tienen nombre "lógico", si no que las almacena como F001, F002...., después, las canciones no tienen nombre, si no letras como VKGH, en fin, que es demasiado aleatorio y costoso.
Yo te recomendaría utilizar el copypod, con un solo botón haces el backup de todo el contenido del ipod. Se supone que es de pago, pero puedes encontrarlo en la mula.