Este problema tambien se presenta cuando en la maquina tienes algun programa como el O&O Defrag, y algunas versiones anteriores al Winamp, algunos antivirus,etc, estos programas toman el ipod como unidad aunque no tengas habilitado el ipod como disco duro, la solucion es encontrar cual es el programa que lo esta usando, cerarlo desde al administrador de tareas y listo, el ipod se desconecta normal.
Porque si desconectas desde el comando detener del USB tampoco te va a dejar, te va a decir que el ipod esta siendo utilizando por una aplicacion y no se pude desconectar.
En mi caso muy particular el que me impide desconetar mi ipod de vez en cuando es el O&O Defrag, pero la parte que se activa cuando inicia windows, nomas lo apago desde el adminstrador de tareas y listo, el ipod solito se desconeta cuando termina la sincronizacion.
En la web hay varias utilerias que te ayudan a encontrar cual programa tiene agarrado cietas aplicaciones USB.
Mi mascota un Loro, mi auto un Mustang, mi musica en un Ipod de 160 gb.