Problema con algún video

Primero, no se si este es el sitio correcto para exponer mi problema, asi que si alguien considera que hay que moverlo, adelante.

Por ahora no he tenido ningún problema a la hora de pasar un vídeo a mi iPod pero lo que si me ha pasado es que al convertir uno de ellos (un concierto de 1:36hr de duración) se desincronizan audio y vídeo. Ya he probado con dos programas, ImToo iPod Movie Converter y Videora iPod converter y no hay manera.
¿Alguna ayudita?

Puede ser que tenga ese video alguna combinación de codec/bitrate en particular y por eso esté causando problema o que el archivo en si esté dañado. Si bien es trabajoso, en caso de no poder conseguirlo de otro lugar, en tu lugar intentaria recodificar ese archivo de video utilizando el programa VirtualDub. Es decir, recomprimirlo usando una configuración estandar.

Vale, muchas gracias, lo intentaré primero con el VirtualDub.