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Me parece que si el iPod está formateado en Windows en modo FAT32 puede ser usado en Mac y PC pero si ha sido formateado en Mac sólo puede usarse en Mac. Ah, para cambiar de plataforma me temo que has de restaurar el iPod con lo que vas a perder todo su contenido.
En cualquier caso puedes usar algún programa como Anapod Explorer, Ephpod o Sharepod para pasar el contenido de tu iPod al pc.
Saludos.