Pues eso si podría tener su explicación lógica. Ten en cuenta que el iPod se maneja con un buffer (una especie de memoria en donde guarda por "adelantado" parte de la canción que estás escuchando. Entonces, si le pones en pausa, queda todo en "espera" y luego le das play... Continua la reproducción directamente desde ese buffer y luego recién vuelve a leer del disco. No sé si realmente es eso lo que sucede, pero tiene un poco de lógica.