Hola forera, bienvenida
Mira, al tener el ipod conectado al pc, sale lo de no desconectar. Ahora, si lo estás gestionando automáticamente, sólo se quita el mensaje, esto, después de que hiciste las modificaciones al ipod (como agregar o quitar canciones). Pero si lo estás gestionando manualmente, tú tendrás que desconectar tu ipod, como debe de ser. Ya sea pinchando el botón de expulsión desde el itunes, o (y es el mejor) quitar hardware con seguridad, desde la barra de tu pc. Saludos